Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERFP50548 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms