Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms