Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA2P26232 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA2P26232 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms