Protein–RNA interactions for Protein: P15813

CD1D, Antigen-presenting glycoprotein CD1d, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1DP15813 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD1DP15813 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD1DP15813 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD1DP15813 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD1DP15813 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD1DP15813 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD1DP15813 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD1DP15813 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD1DP15813 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD1DP15813 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CD1DP15813 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD1DP15813 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CD1DP15813 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD1DP15813 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD1DP15813 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD1DP15813 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD1DP15813 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD1DP15813 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD1DP15813 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CD1DP15813 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD1DP15813 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD1DP15813 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD1DP15813 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD1DP15813 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD1DP15813 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD1DP15813 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD1DP15813 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD1DP15813 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD1DP15813 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD1DP15813 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD1DP15813 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD1DP15813 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD1DP15813 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD1DP15813 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD1DP15813 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD1DP15813 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD1DP15813 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD1DP15813 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD1DP15813 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD1DP15813 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD1DP15813 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD1DP15813 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CD1DP15813 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD1DP15813 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD1DP15813 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD1DP15813 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD1DP15813 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD1DP15813 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD1DP15813 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD1DP15813 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD1DP15813 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD1DP15813 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD1DP15813 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD1DP15813 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD1DP15813 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD1DP15813 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD1DP15813 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD1DP15813 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD1DP15813 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD1DP15813 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD1DP15813 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD1DP15813 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD1DP15813 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD1DP15813 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD1DP15813 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD1DP15813 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD1DP15813 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms