Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM27P14373 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms