Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH1P12830 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH1P12830 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH1P12830 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH1P12830 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH1P12830 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH1P12830 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH1P12830 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH1P12830 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH1P12830 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH1P12830 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH1P12830 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH1P12830 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH1P12830 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH1P12830 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDH1P12830 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDH1P12830 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDH1P12830 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDH1P12830 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDH1P12830 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDH1P12830 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDH1P12830 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDH1P12830 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDH1P12830 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH1P12830 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH1P12830 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH1P12830 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH1P12830 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH1P12830 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH1P12830 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH1P12830 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH1P12830 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH1P12830 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH1P12830 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH1P12830 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH1P12830 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH1P12830 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDH1P12830 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH1P12830 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH1P12830 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms