Protein–RNA interactions for Protein: P01782

IGHV3-9, Immunoglobulin heavy variable 3-9, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-9P01782 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-9P01782 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-9P01782 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-9P01782 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-9P01782 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-9P01782 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-9P01782 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-9P01782 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-9P01782 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-9P01782 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-9P01782 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-9P01782 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-9P01782 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-9P01782 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-9P01782 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-9P01782 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-9P01782 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-9P01782 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms