Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms