Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-1B6SEH8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms