Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms