Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms