Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC144AA2RUR9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC144AA2RUR9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms