Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms