Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
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