Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms