Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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RABGEF1Q9UJ41 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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RABGEF1Q9UJ41 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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RABGEF1Q9UJ41 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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RABGEF1Q9UJ41 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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RABGEF1Q9UJ41 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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RABGEF1Q9UJ41 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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RABGEF1Q9UJ41 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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RABGEF1Q9UJ41 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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RABGEF1Q9UJ41 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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