Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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