Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
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