Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms