Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms