Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MEPEQ9NQ76 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms