Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIXL1Q9H2W2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms