Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CADM1Q9BY67 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms