Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A3Q9BRY0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms