Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms