Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD1Q6UXZ0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms