Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD40Q6AI12 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms