Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBAP2Q5T6F2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms