Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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