Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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