Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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PEX6Q13608 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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PEX6Q13608 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
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