Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms