Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms