Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms