Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB15P59190 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB15P59190 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB15P59190 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB15P59190 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB15P59190 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB15P59190 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB15P59190 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB15P59190 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB15P59190 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB15P59190 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB15P59190 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB15P59190 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB15P59190 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB15P59190 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB15P59190 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB15P59190 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB15P59190 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB15P59190 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB15P59190 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB15P59190 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB15P59190 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB15P59190 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB15P59190 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB15P59190 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB15P59190 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB15P59190 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB15P59190 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB15P59190 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB15P59190 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB15P59190 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB15P59190 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms