Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms