Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRGP23470 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRGP23470 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
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