Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
U2AF1L5P0DN76 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms