Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms