Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFMP07197 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFMP07197 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFMP07197 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFMP07197 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFMP07197 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFMP07197 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFMP07197 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFMP07197 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFMP07197 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFMP07197 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFMP07197 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFMP07197 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFMP07197 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFMP07197 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFMP07197 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFMP07197 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFMP07197 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFMP07197 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFMP07197 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFMP07197 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFMP07197 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFMP07197 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFMP07197 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFMP07197 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFMP07197 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFMP07197 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFMP07197 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFMP07197 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFMP07197 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFMP07197 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFMP07197 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFMP07197 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFMP07197 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFMP07197 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFMP07197 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFMP07197 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFMP07197 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFMP07197 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFMP07197 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFMP07197 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFMP07197 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFMP07197 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms