Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TK1P04183 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TK1P04183 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TK1P04183 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TK1P04183 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TK1P04183 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TK1P04183 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms