Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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