Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP2O75323 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms