Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms