Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms