Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms