Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL33A6NCF5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms