Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
V9GYV3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
V9GYV3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
V9GYV3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
V9GYV3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
V9GYV3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
V9GYV3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
V9GYV3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
V9GYV3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
V9GYV3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
V9GYV3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
V9GYV3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
V9GYV3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
V9GYV3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
V9GYV3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
V9GYV3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GYV3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GYV3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GYV3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GYV3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GYV3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GYV3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GYV3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GYV3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GYV3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GYV3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GYV3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GYV3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GYV3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GYV3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GYV3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GYV3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GYV3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GYV3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GYV3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GYV3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GYV3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GYV3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GYV3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GYV3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GYV3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GYV3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GYV3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GYV3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GYV3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GYV3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GYV3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GYV3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GYV3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GYV3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GYV3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GYV3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
V9GYV3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
V9GYV3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
V9GYV3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
V9GYV3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
V9GYV3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
V9GYV3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
V9GYV3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
V9GYV3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
V9GYV3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
V9GYV3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
V9GYV3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
V9GYV3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
V9GYV3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
V9GYV3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
V9GYV3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
V9GYV3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
V9GYV3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
V9GYV3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
V9GYV3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
V9GYV3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
V9GYV3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
V9GYV3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
V9GYV3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
V9GYV3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
V9GYV3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
V9GYV3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
V9GYV3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
V9GYV3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
V9GYV3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
V9GYV3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
V9GYV3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
V9GYV3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
V9GYV3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
V9GYV3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
V9GYV3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
V9GYV3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
V9GYV3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
V9GYV3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
V9GYV3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
V9GYV3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
V9GYV3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
V9GYV3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
V9GYV3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
V9GYV3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
V9GYV3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
V9GYV3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
V9GYV3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
V9GYV3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms