Protein–RNA interactions for Protein: R4GN57

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GN57 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
R4GN57 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
R4GN57 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
R4GN57 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
R4GN57 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
R4GN57 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
R4GN57 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
R4GN57 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
R4GN57 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
R4GN57 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
R4GN57 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
R4GN57 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
R4GN57 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
R4GN57 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
R4GN57 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
R4GN57 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
R4GN57 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
R4GN57 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
R4GN57 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
R4GN57 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
R4GN57 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
R4GN57 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
R4GN57 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
R4GN57 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
R4GN57 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
R4GN57 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
R4GN57 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
R4GN57 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
R4GN57 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
R4GN57 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
R4GN57 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
R4GN57 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
R4GN57 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
R4GN57 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
R4GN57 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
R4GN57 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
R4GN57 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
R4GN57 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
R4GN57 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
R4GN57 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
R4GN57 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
R4GN57 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
R4GN57 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
R4GN57 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
R4GN57 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
R4GN57 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
R4GN57 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
R4GN57 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
R4GN57 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
R4GN57 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
R4GN57 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
R4GN57 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
R4GN57 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
R4GN57 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R4GN57 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R4GN57 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R4GN57 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
R4GN57 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R4GN57 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
R4GN57 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
R4GN57 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
R4GN57 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
R4GN57 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
R4GN57 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
R4GN57 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
R4GN57 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
R4GN57 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
R4GN57 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
R4GN57 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
R4GN57 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
R4GN57 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
R4GN57 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
R4GN57 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
R4GN57 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
R4GN57 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
R4GN57 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
R4GN57 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
R4GN57 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
R4GN57 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
R4GN57 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
R4GN57 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
R4GN57 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
R4GN57 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
R4GN57 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
R4GN57 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
R4GN57 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
R4GN57 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
R4GN57 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
R4GN57 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
R4GN57 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
R4GN57 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
R4GN57 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
R4GN57 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
R4GN57 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
R4GN57 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
R4GN57 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
R4GN57 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
R4GN57 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
R4GN57 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
R4GN57 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms