Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y639

NPTN, Neuroplastin, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTNQ9Y639 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPTNQ9Y639 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NPTNQ9Y639 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms